Орган Kuhn, установленный в соборе на Малой Грузинской, — четвёртый по величине в России: 74 регистра, 5563 трубы. Уникальный инструмент привлекает в Собор Непорочного Зачатия Девы Марии органистов из Европы и Америки. Ежегодно концерты в храме посещают более 120 000 зрителей. Культурной программой занимается фонд «Искусство добра» — благодаря команде фонда здесь регулярно выступают музыканты с мировым именем, а духовная музыка чередуется с популярной академической. В храме звучит не только классика: на местном органе играли даже джаз и саундтреки из «Звёздных воин». В соборе проходили международный фестиваль гитаристов и композиторов, чтения «Маленького принца» на фоне песочной анимации и многое другое. На богослужениях поочерёдно выступают два местных хора — Литургический и Академический.